Package: LSVI 0.1.4

Els Lommelen

LSVI: Rekenmodule Lokale Staat Van Instandhouding van habitattypen

Het package LSVI bundelt een aantal functies in verband met het ophalen van informatie over en het berekenen van de Lokale Staat Van Instandhouding (LSVI) van habitattypes.

Authors:Els Lommelen [aut, cre], Patrik Oosterlynck [aut], Gert Van Spaendonk [aut], Hans Van Calster [aut], Martine Van Hove [aut], Toon Westra [aut], An Leyssen [ctb], Toon Spanhove [ctb], Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek [cph, fnd]

LSVI_0.1.4.tar.gz
LSVI_0.1.4.zip(r-4.7)LSVI_0.1.4.zip(r-4.6)LSVI_0.1.4.zip(r-4.5)
LSVI_0.1.4.tgz(r-4.6-any)LSVI_0.1.4.tgz(r-4.5-any)
LSVI_0.1.4.tar.gz(r-4.7-any)LSVI_0.1.4.tar.gz(r-4.6-any)
LSVI_0.1.4.tgz(r-4.6-emscripten)
manual.pdf |manual.html✨
DESCRIPTION |NEWS
card.svg |card.png
LSVI/json (API)

# Install 'LSVI' in R:
install.packages('LSVI', repos = c('https://inbo.r-universe.dev', 'https://cloud.r-project.org'))

Bug tracker:https://github.com/inbo/lsvi/issues

On CRAN:

Conda:

4.15 score 1 stars 28 scripts 30 exports 77 dependencies

Last updated from:c7325cf2a3. Checks:9 OK. Indexed: yes.

TargetResultTimeFilesSyslog
linux-devel-x86_64OK284
source / vignettesOK226
linux-release-x86_64OK264
macos-release-arm64OK203
macos-oldrel-arm64OK231
windows-develOK216
windows-releaseOK222
windows-oldrelOK341
wasm-releaseOK173

Exports:berekenLSVIbasisberekenStatusberekenVerschilscoresberekenVoorwaardecombinerenVerschilscorecombinerenVoorwaardenconnecteerMetLSVIdbcontroleerInvoerwaardedeselecteerKenmerkenInOpnamegeefInfoHabitatfichegeefInvoervereistengeefSoortenlijstgeefSoortenlijstVoorIDsgeefUniekeWaardengeefVersieInfogeefVertaallijstinvoercontroleData_habitatinvoercontroleData_soortenKenmerkeninvoercontroleData_voorwaardeninvoercontroleKwaliteitsniveauinvoercontroleVersielogDatabankfoutenmaakConnectiePoolmaakHabitatfichesmaakLSVIrapportparseTaxonnaamselecteerIndicatorenselecteerKenmerkenInOpnamevertaalIntervalUitvoervertaalInvoerInterval

Dependencies:askpassassertthatbase64encbitbit64blobbslibcachemclicpp11crulcurldata.tableDBIdigestdplyrevaluatefarverfastmapfontawesomefsgenericsggplot2gluegtablehighrhmshtmltoolshttpcodehttrisobandjquerylibjsonliteknitrlabelinglaterlazyevallifecyclemagrittrmemoisemimeoaiodbcopensslpillarpkgconfigplyrpoolpurrrR6rappdirsRColorBrewerRcpprgbifrlangrmarkdownRSQLiteS7sassscalesstringistringrsystibbletidyrtidyselecttinytextriebeardurltoolsutf8vctrsviridisLitewhiskerwithrxfunxml2yaml

Handleiding LSVI-package
Leeswijzer | Doelstellingen en inhoud package | Inhoud package | Doelstellingen | Installatie van het package | Gebruik basisfuncties | Wegwijs in R | R, RStudio, scripts en projecten | Packages en documentatie | Wat met gegenereerde gegevens in tabelvorm? | Hoe eigen gegevens inlezen in R? | Wat met een list van tabellen? | Basis van LSVI-package | Connecteren met de databank | Gebruik van de functies zelf
Rendered fromHandleiding.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2026-05-04
Started: 2020-02-25

Technische achtergrond bij de berekeningen
Inleiding | Beschikbare gegevens en informatie | Algemene workflow | Berekening van voorwaarden | Rekenregels | AnalyseVariabele | aantal | bedekking | bedekkingExcl | bedekkingLaag | bedekkingLaagExcl | bedekkingLaagPlus | bedekkingSom | maxBedekking | maxBedekking2s | maxBedekkingExcl | aandeel | aandeelKruidlaag | aandeelLaagExcl | aantalGroepen | scoresom | meting | Afhandeling taxonlijsten | Bedekking en schalen | Status | Distance-to-target
Rendered fromBerekeningen.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2026-05-04
Started: 2020-02-25

Readme and manuals

Help Manual

Help pageTopics
Berekent de LSVI op basis van VoorwaardeID en opgegeven waardenberekenLSVIbasis
Berekent de Status voor de records van een een opgegeven tabelberekenStatus
Berekent de verschilscores voor de records van een een opgegeven tabelberekenVerschilscores
Berekent de voorwaarde op basis van datasetsberekenVoorwaarde
combineert de Verschilscores van voorwaarden die via EN of OF logische operatoren gelinkt zijncombinerenVerschilscore
combineert de Status van voorwaarden via de opgegeven formulecombinerenVoorwaarden
Connecteer met de databank met LSVI-indicatoren in het packageconnecteerMetLSVIdb
Hulpfunctie voor het uitvoeren van foutcontrolescontroleerInvoerwaarde
Controle van de ingevoerde opnamedeselecteerKenmerkenInOpname
Geeft tabel met info uit de LSVI-rapporten voor de opgegeven parametersgeefInfoHabitatfiche
Geeft de invoervereisten voor de waarde van een opnamegeefInvoervereisten
Genereert soortenlijst(en) LSVI op basis van de opgegeven parametersgeefSoortenlijst
Genereert soorten(groep)lijst(en) LSVI op basis van TaxongroepIDgeefSoortenlijstVoorIDs
Geef alle unieke waarden van een veld uit de databank met de LSVI-indicatoren voorafgegaan door "alle"geefUniekeWaarden
Geeft informatie over de verschillende versies voor de berekening van de LSVIgeefVersieInfo
Haalt vertaallijst op uit databankgeefVertaallijst
Invoercontrole voor dataframe Data_habitatinvoercontroleData_habitat
Invoercontrole voor dataframe 'Data_soortenKenmerken'invoercontroleData_soortenKenmerken
Invoercontrole voor dataframe Data_voorwaardeninvoercontroleData_voorwaarden
Invoercontrole voor waarde KwaliteitsniveauinvoercontroleKwaliteitsniveau
Invoercontrole voor waarde versieinvoercontroleVersie
Lijst alle nog op te lossen databankfouten oplogDatabankfouten
Maak een connectiepool met de databank met LSVI-indicatoren in het packagemaakConnectiePool
Genereert habitatfiche(s) van LSVI op basis van de opgegeven parametersmaakHabitatfiches
Genereert LSVI-rapport op basis van de opgegeven parametersmaakLSVIrapport
Vereenvoudig de soortnaam door de auteurs te verwijderenparseTaxonnaam
Selecteert indicatoren LSVI op basis van de opgegeven parametersselecteerIndicatoren
Controle van de ingevoerde opnameselecteerKenmerkenInOpname
zet een interval om naar een waarde in de gevraagde eenheidvertaalIntervalUitvoer
zet ingevoerde gegevens om naar een intervalvertaalInvoerInterval