Package: LSVI 0.1.3

Els Lommelen

LSVI: Rekenmodule Lokale Staat Van Instandhouding van habitattypen

Het package LSVI bundelt een aantal functies in verband met het ophalen van informatie over en het berekenen van de Lokale Staat Van Instandhouding (LSVI) van habitattypes.

Authors:Els Lommelen [aut, cre], Patrik Oosterlynck [aut], Gert Van Spaendonk [aut], Hans Van Calster [aut], Martine Van Hove [aut], Toon Westra [aut], An Leyssen [ctb], Toon Spanhove [ctb], Research Institute for Nature and Forest [cph]

LSVI_0.1.3.tar.gz
LSVI_0.1.3.zip(r-4.5)LSVI_0.1.3.zip(r-4.4)LSVI_0.1.3.zip(r-4.3)
LSVI_0.1.3.tgz(r-4.5-any)LSVI_0.1.3.tgz(r-4.4-any)LSVI_0.1.3.tgz(r-4.3-any)
LSVI_0.1.3.tar.gz(r-4.5-noble)LSVI_0.1.3.tar.gz(r-4.4-noble)
LSVI_0.1.3.tgz(r-4.4-emscripten)LSVI_0.1.3.tgz(r-4.3-emscripten)
LSVI.pdf |LSVI.html✨
LSVI/json (API)
NEWS

# Install 'LSVI' in R:
install.packages('LSVI', repos = c('https://inbo.r-universe.dev', 'https://cloud.r-project.org'))

Bug tracker:https://github.com/inbo/lsvi/issues

On CRAN:

Conda:

4.03 score 1 stars 27 scripts 30 exports 106 dependencies

Last updated 2 years agofrom:c709f03118. Checks:1 OK, 7 NOTE. Indexed: yes.

TargetResultLatest binary
Doc / VignettesOKFeb 15 2025
R-4.5-winNOTEFeb 15 2025
R-4.5-macNOTEFeb 15 2025
R-4.5-linuxNOTEFeb 15 2025
R-4.4-winNOTEFeb 15 2025
R-4.4-macNOTEFeb 15 2025
R-4.3-winNOTEFeb 15 2025
R-4.3-macNOTEFeb 15 2025

Exports:berekenLSVIbasisberekenStatusberekenVerschilscoresberekenVoorwaardecombinerenVerschilscorecombinerenVoorwaardenconnecteerMetLSVIdbcontroleerInvoerwaardedeselecteerKenmerkenInOpnamegeefInfoHabitatfichegeefInvoervereistengeefSoortenlijstgeefSoortenlijstVoorIDsgeefUniekeWaardengeefVersieInfogeefVertaallijstinvoercontroleData_habitatinvoercontroleData_soortenKenmerkeninvoercontroleData_voorwaardeninvoercontroleKwaliteitsniveauinvoercontroleVersielogDatabankfoutenmaakConnectiePoolmaakHabitatfichesmaakLSVIrapportparseTaxonnaamselecteerIndicatorenselecteerKenmerkenInOpnamevertaalIntervalUitvoervertaalInvoerInterval

Dependencies:askpassassertthatbase64encbitbit64blobbriobslibcachemcallrclicliprcolorspacecpp11crayoncrulcurldata.tableDBIdescdiffobjdigestdplyrevaluatefansifarverfastmapfontawesomefsgenericsggplot2gluegtablehighrhmshtmltoolshttpcodehttrisobandjquerylibjsonliteknitrlabelinglaterlatticelazyevallifecyclemagrittrMASSMatrixmemoisemgcvmimemunsellnlmeoaiodbcopensslpillarpkgbuildpkgconfigpkgloadplogrplyrpoolpraiseprettyunitsprocessxprogresspspurrrR6rappdirsRColorBrewerRcppreadrrgbifrlangrmarkdownrprojrootRSQLitesassscalesstringistringrsystestthattibbletidyrtidyselecttinytextriebeardtzdburltoolsutf8vctrsviridisLitevroomwaldowhiskerwithrwkxfunxml2xtableyaml

Handleiding LSVI-package

Els Lommelen

Rendered fromHandleiding.Rmdusingknitr::rmarkdownon Feb 15 2025.

Last update: 2021-10-15
Started: 2020-02-25

Technische achtergrond bij de berekeningen

Els Lommelen, Toon Westra en Hans Van Calster

Rendered fromBerekeningen.Rmdusingknitr::rmarkdownon Feb 15 2025.

Last update: 2023-08-01
Started: 2020-02-25

Readme and manuals

Help Manual

Help pageTopics
Berekent de LSVI op basis van VoorwaardeID en opgegeven waardenberekenLSVIbasis
Berekent de Status voor de records van een een opgegeven tabelberekenStatus
Berekent de verschilscores voor de records van een een opgegeven tabelberekenVerschilscores
Berekent de voorwaarde op basis van datasetsberekenVoorwaarde
combineert de Verschilscores van voorwaarden die via EN of OF logische operatoren gelinkt zijncombinerenVerschilscore
combineert de Status van voorwaarden via de opgegeven formulecombinerenVoorwaarden
Connecteer met de databank met LSVI-indicatoren in het packageconnecteerMetLSVIdb
Hulpfunctie voor het uitvoeren van foutcontrolescontroleerInvoerwaarde
Controle van de ingevoerde opnamedeselecteerKenmerkenInOpname
Geeft tabel met info uit de LSVI-rapporten voor de opgegeven parametersgeefInfoHabitatfiche
Geeft de invoervereisten voor de waarde van een opnamegeefInvoervereisten
Genereert soortenlijst(en) LSVI op basis van de opgegeven parametersgeefSoortenlijst
Genereert soorten(groep)lijst(en) LSVI op basis van TaxongroepIDgeefSoortenlijstVoorIDs
Geef alle unieke waarden van een veld uit de databank met de LSVI-indicatoren voorafgegaan door "alle"geefUniekeWaarden
Geeft informatie over de verschillende versies voor de berekening van de LSVIgeefVersieInfo
Haalt vertaallijst op uit databankgeefVertaallijst
Invoercontrole voor dataframe Data_habitatinvoercontroleData_habitat
Invoercontrole voor dataframe Data_soortenKenmerkeninvoercontroleData_soortenKenmerken
Invoercontrole voor dataframe Data_voorwaardeninvoercontroleData_voorwaarden
Invoercontrole voor waarde KwaliteitsniveauinvoercontroleKwaliteitsniveau
Invoercontrole voor waarde versieinvoercontroleVersie
Lijst alle nog op te lossen databankfouten oplogDatabankfouten
Maak een connectiepool met de databank met LSVI-indicatoren in het packagemaakConnectiePool
Genereert habitatfiche(s) van LSVI op basis van de opgegeven parametersmaakHabitatfiches
Genereert LSVI-rapport op basis van de opgegeven parametersmaakLSVIrapport
Vereenvoudig de soortnaam door de auteurs te verwijderenparseTaxonnaam
Selecteert indicatoren LSVI op basis van de opgegeven parametersselecteerIndicatoren
Controle van de ingevoerde opnameselecteerKenmerkenInOpname
zet een interval om naar een waarde in de gevraagde eenheidvertaalIntervalUitvoer
zet ingevoerde gegevens om naar een intervalvertaalInvoerInterval